кратеры и пузырьки от того что бетонная стяжка сосала воду из наливного пола и при заполнении микропустот в стяжке из них освобождался воздух который наделал таких кратеров. Если не всё залили, попробуйте на стяжку ливануть воды и увидите как она "шипит". Как вариант грунтовать на 2 -3 раза.