Врубаться ради чего — прослабить стену, получить предельную жесткость?
Предельную жесткость обеспечат бруски-направляющие, отсутствие врубания — вариабельность планировки. Вдруг захотите передвинуть потом перегородку.
Ответ: врубаться не обязательно.