Не вижу связи между вентиляцией (чего?) и материалом перекрытия. Из санитарных запретов: ДСП конечно не надо стелить, потому что этот материал выделяет вредные вещества (связующие).
Так и фанера не на клейстере изготавливается. Самый экологичный вариант — набор ничем не пропитанных строганых досок, типа половых, с системой шип-паз.
фанеру и ДВП кладут на кровати из экономии, ДСП дороже. Есть кровати с основанием из ЛДСП по СанПиНу. Вентиляцию сквозь матрас слабо представляю, всё вверх выйдет.