Т.е. вводите первый этаж — а чердак делаете потом? Можно, квадраты регистрируются по факту, а что будет потом — это уже другой вопрос.
Один только момент — сделать холодную крышу, а потом из нее мансардную, если по правилам, без полной разборки не обойтись. рекомендовал бы мансардный пирог сразу делать.